More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6535 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 394 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  39.9 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  32.66 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  39.51 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  35.07 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  34.11 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  33.25 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  33.79 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  30.37 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  33.16 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  31.86 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.95 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.38 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  30.42 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.33 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  26.14 
 
 		 526 aa  95.5  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.92 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.92 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.15 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 448 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  30.47 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  26.8 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  27.01 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.22 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  30.11 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.21 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 364 aa  86.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.66 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.82 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.97 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.82 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.82 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.82 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.82 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.97 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.66 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.97 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  30.37 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  28.75 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.66 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.12 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.94 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.51 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.71 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  24.5 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  25.08 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.71 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.95 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.28 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  21.99 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  31.89 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.28 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.47 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  23.89 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2801  hypothetical protein  24.6 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  27.81 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  23.91 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  23.62 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  24 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.4 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.67 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  25.17 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  26.28 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27.78 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  28.15 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  24.28 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  26.35 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  28.76 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  21.11 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  24.76 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  21.67 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  32.05 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.08 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.63 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.42 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  23.82 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  21.85 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.75 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>