More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8629 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  100 
 
 		 423 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  53.88 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  54.31 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  47.81 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  43.71 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  47.63 
 
 		 387 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  42.45 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  44.35 
 
 		 357 aa  249  8e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  39.64 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  32.66 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  41.78 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  39.8 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  33.88 
 
 		 371 aa  183  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  35.58 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  34.48 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.78 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  28.39 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  28.39 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  28.39 
 
 		 348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  28.39 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  28.39 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.53 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.39 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.53 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  28.39 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  28.67 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.05 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.44 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  39.12 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.1 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.87 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  28.21 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.23 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.66 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.36 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.04 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  28.04 
 
 		 526 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.95 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.18 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.18 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  24.61 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.93 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  30.42 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.33 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.33 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.33 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.33 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.33 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  29.08 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.21 
 
 		 355 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.15 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.55 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  27.15 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.71 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  25.47 
 
 		 366 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.68 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 368 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.82 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.82 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.82 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.82 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.82 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.77 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.49 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.16 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25.71 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  25.16 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.19 
 
 		 349 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.33 
 
 		 373 aa  93.2  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.3 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  25.61 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  26.33 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  26.32 
 
 		 348 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  26.07 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  25.24 
 
 		 344 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  27.03 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.42 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>