More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3863 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  56.73 
 
 
340 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  52.77 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  53.91 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  55.3 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  55.65 
 
 
345 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  55.36 
 
 
345 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  49.86 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  43.02 
 
 
349 aa  285  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  47.49 
 
 
344 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  47.2 
 
 
344 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  50.44 
 
 
336 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  47.53 
 
 
387 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  46.38 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  38.83 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  36.06 
 
 
358 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  35.21 
 
 
358 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  51.15 
 
 
357 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  42.62 
 
 
360 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  42.37 
 
 
359 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  34.56 
 
 
347 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  34.1 
 
 
347 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  43.25 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  34.13 
 
 
347 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  31.69 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  34.04 
 
 
356 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
529 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  33.2 
 
 
329 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  33.08 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  33.89 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  34.65 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  32.52 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  28.05 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  32.22 
 
 
340 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.07 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.9 
 
 
351 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.82 
 
 
349 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 
364 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  32.49 
 
 
372 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  29.28 
 
 
340 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  32.35 
 
 
346 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.07 
 
 
341 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 
388 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  28.38 
 
 
387 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 
376 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  30.07 
 
 
381 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  27.03 
 
 
368 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.78 
 
 
343 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.04 
 
 
368 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  35.16 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.18 
 
 
423 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  29.3 
 
 
363 aa  93.2  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  30.56 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.31 
 
 
423 aa  89.4  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  22.79 
 
 
365 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  27.39 
 
 
443 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  31.12 
 
 
395 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.4 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 
389 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.92 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.08 
 
 
361 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  31.17 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  32.74 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.14 
 
 
404 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  26.91 
 
 
455 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  32.65 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  32.65 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.05 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.05 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.05 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.05 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  26.39 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.05 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 
400 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  28.92 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.05 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.05 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.71 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.09 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.71 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  28.34 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  20.94 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  31.98 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.6 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.15 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.54 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  27.76 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  25.66 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28 
 
 
665 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  29.39 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>