293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10101 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10101  permease  100 
 
 
347 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  78.36 
 
 
347 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  76.9 
 
 
347 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  78.03 
 
 
347 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  44.93 
 
 
359 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  43.02 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  43.77 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  40.49 
 
 
360 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  44.12 
 
 
359 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  35.86 
 
 
340 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  38.95 
 
 
359 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  32.85 
 
 
344 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  32.43 
 
 
349 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  33.89 
 
 
382 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  30.38 
 
 
372 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  33.92 
 
 
379 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 
336 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  31.33 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 
345 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 
345 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  28.73 
 
 
344 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  29.64 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  42.17 
 
 
357 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  23.29 
 
 
329 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  25.62 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  25.57 
 
 
356 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  27.08 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  25.14 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  29.51 
 
 
381 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  27.87 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  25.3 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  23.7 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.61 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.1 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  29.51 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.84 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.25 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.15 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  28.23 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  25.24 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  22.84 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  26.52 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.34 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  28.18 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  21.25 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  26.92 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  23.26 
 
 
400 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  22.62 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  26.92 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  28.49 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  23.33 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  24.02 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  22.12 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  23.21 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  23.29 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  23.84 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  19.36 
 
 
529 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  27.53 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  27.53 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  27.53 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.57 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13163  permease  25.44 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.74 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.74 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.26 
 
 
405 aa  62.8  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.41 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.74 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.74 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.41 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.74 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.19 
 
 
348 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  20.3 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.41 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  20.93 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  24.04 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  25.56 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.19 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.2 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.67 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.81 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  21.48 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  23.03 
 
 
429 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  22.83 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  22.83 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  22.83 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  22.83 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.88 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  28.23 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.97 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  28.23 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  28.23 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>