More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1078 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
336 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  51.62 
 
 
340 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  50.29 
 
 
379 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  49.41 
 
 
372 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  47.65 
 
 
349 aa  281  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  50.44 
 
 
347 aa  279  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  47.34 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  48.1 
 
 
382 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  44.26 
 
 
387 aa  247  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  45.85 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  45.85 
 
 
345 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  42.73 
 
 
344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  42.73 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  38.29 
 
 
359 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  43.15 
 
 
345 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  36.47 
 
 
358 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  35.61 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  38.59 
 
 
360 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  50.15 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  32.75 
 
 
347 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  38.64 
 
 
359 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  33.23 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  32.82 
 
 
347 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  32.54 
 
 
347 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  31.72 
 
 
372 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  38.18 
 
 
359 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  31.33 
 
 
356 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  31.1 
 
 
340 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  30.13 
 
 
350 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  32.99 
 
 
340 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  30.75 
 
 
364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  31.14 
 
 
349 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  29.54 
 
 
346 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  30.3 
 
 
329 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  30 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.43 
 
 
354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  32.08 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.86 
 
 
349 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.79 
 
 
381 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  28.57 
 
 
370 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  31.61 
 
 
424 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  30.18 
 
 
435 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  25.64 
 
 
381 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.05 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  29.07 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  27.41 
 
 
386 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  33.78 
 
 
365 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.84 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.97 
 
 
351 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  27.24 
 
 
346 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.52 
 
 
383 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  29.15 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.9 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.54 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.2 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 
529 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 
395 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  27.83 
 
 
436 aa  89.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  25.77 
 
 
387 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  25.31 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 
392 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  31.75 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  29.76 
 
 
368 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.75 
 
 
377 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  26.64 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.9 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.9 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.9 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  27.18 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.76 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.9 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.71 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  24.57 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.24 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  21.57 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  21.57 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  21.57 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2750  hypothetical protein  29.7 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  21.24 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  21.24 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.04 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.04 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.14 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.04 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.14 
 
 
402 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  25.73 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  25.73 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  25.73 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.73 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>