More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_16401  permease  100 
 
 		 333 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  69.97 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  69.97 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  36.44 
 
 		 387 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  32.61 
 
 		 382 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  32.94 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  31.81 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  27.45 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  29.41 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  27.92 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  32.36 
 
 		 379 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  35.69 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  32.44 
 
 		 372 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  32.26 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  27.19 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  32.63 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  31.86 
 
 		 344 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  31.86 
 
 		 344 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  26.02 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  35.6 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  32.73 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  27.86 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  32.52 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  31.12 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  24.57 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  38.83 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  38.83 
 
 		 401 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  34.34 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  37.77 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  28.9 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  29.75 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  31.81 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  29.43 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  31.27 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  36.6 
 
 		 346 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  40.91 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  30.96 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  30.69 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  26.71 
 
 		 382 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 		 529 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  28.47 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.4 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.16 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  24.7 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  32.55 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  23.8 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  31.28 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  27.67 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  29.75 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  34.02 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  27.18 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.64 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25.56 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2589  hypothetical protein  27.18 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.72 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  20.42 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  23.39 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  20.42 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.41 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  23.74 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  23.82 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  21.21 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  25.89 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  21.75 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.25 
 
 		 412 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  25.75 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.67 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.02 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.77 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  21.07 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.18 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  20.75 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.03 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.26 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.75 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.63 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.31 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  20.32 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  23.76 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  29.22 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  31.86 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>