More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1508 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 395 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  89.7 
 
 		 392 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  90.73 
 
 		 401 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  64.36 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  58.24 
 
 		 353 aa  338  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  41.71 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  41.22 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  41.07 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  40.83 
 
 		 379 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  41.53 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  42.67 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  40 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  35.05 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  36.65 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  47.91 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  33.59 
 
 		 350 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  47.44 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  33.04 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  29.14 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  38.52 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  36.06 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  27.47 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  41.32 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  27.81 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  34.67 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  32.8 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  29.96 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  38.16 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  24.38 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  32.16 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  28.5 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  28.99 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  34.94 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  37.56 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  24.08 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.7 
 
 		 341 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  31.52 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  34.34 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  27.87 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  29.07 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  30.23 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  29.07 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  32.41 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  32.07 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  26.17 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.32 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  38.36 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  31.05 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  31.61 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  30.92 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.98 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  31.25 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.9 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  36.89 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  37.5 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  37.38 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  30.07 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  30.07 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  21.77 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  28.7 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.73 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.8 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.45 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.05 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.8 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.73 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.73 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  30.11 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28.33 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  33.16 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  28.35 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  28.21 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  36.41 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.99 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  28.39 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  22.58 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  28.39 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  28.39 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.26 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  28.39 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.1 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  32.09 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  28.04 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  28.39 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  31.72 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  36.05 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  29.59 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>