More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2189 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 396 aa  786    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.87 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  32.68 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.8 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  32.06 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  34.39 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.99 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  31.25 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  37.41 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  34.16 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  39.25 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  35.1 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  23.76 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  33.77 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  21.91 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  34.23 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.36 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.55 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.74 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  34.27 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  34.27 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  25.35 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  32.87 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  23.69 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  34.57 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.03 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.41 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.12 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.12 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  24.63 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.9 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.12 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  33.12 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.41 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.12 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  31.73 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  33.68 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.83 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.94 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  27.72 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  31.73 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.05 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.12 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.12 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2453  hypothetical protein  27.27 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  29.12 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  24.65 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  24.49 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  27.07 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  41 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  27.07 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  27.07 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.13 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  25.74 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  21.6 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.46 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  27.94 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.51 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.26 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  28.51 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  39.02 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  25.91 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.22 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.11 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  22.52 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  20.98 
 
 		 663 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  25.88 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.32 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  24.07 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  26.2 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  35.65 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.84 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.27 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.43 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>