More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4286 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  42.4 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  36.81 
 
 
340 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  38.68 
 
 
346 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  36.39 
 
 
364 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  33.66 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 
372 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  34.74 
 
 
340 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  34.39 
 
 
340 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  35.22 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  33.92 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  30.84 
 
 
372 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  32.01 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  30.19 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  28.61 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  29.62 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  35.43 
 
 
354 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  29.45 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  30.25 
 
 
340 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  29.34 
 
 
368 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  30.09 
 
 
395 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  37.56 
 
 
395 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 
383 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.89 
 
 
382 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  27.9 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  42.11 
 
 
392 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  42.11 
 
 
401 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  37.78 
 
 
381 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.61 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  28.9 
 
 
526 aa  95.5  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.31 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  30.21 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
455 aa  94  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  31.64 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  32.77 
 
 
336 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 
529 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  30.36 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.56 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.25 
 
 
344 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  29.88 
 
 
387 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.48 
 
 
349 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.94 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  22.67 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.94 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.86 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.68 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.94 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.94 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.94 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.94 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.94 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  22.94 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.94 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.51 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  31.93 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  31.93 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  31.93 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.15 
 
 
371 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
382 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  30.2 
 
 
369 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  24.48 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  29.91 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  25.8 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  24.18 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  30.69 
 
 
424 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.47 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  30.77 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.09 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  36.88 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.42 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  32.1 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 
438 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.06 
 
 
415 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  32.87 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  30.38 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  30.38 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.42 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  30.38 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  30.38 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  30.38 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.41 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  28.3 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  25.75 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  25.75 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  27.71 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.75 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.14 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  28.67 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  25.75 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.75 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.75 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  35.03 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  26.87 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  29.11 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>