More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3009 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 382 aa  749    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  60.93 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  64.37 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  64.37 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  55.85 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  55.3 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  48.53 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  48.45 
 
 		 372 aa  285  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  44.02 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  48.47 
 
 		 387 aa  272  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  45.92 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  45.63 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  48.1 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  39.72 
 
 		 359 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  43.14 
 
 		 345 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  37.89 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  47.97 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  36.9 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  36.49 
 
 		 360 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  41.93 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  37.5 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  37.5 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  41.69 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  35.6 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  32.48 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  33.85 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  32.85 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  32.52 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  30.29 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  29.31 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  29 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  31.58 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  28.23 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.65 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  29.21 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.69 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  30.69 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  31.75 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.23 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  29.36 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  32 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  92.8  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.32 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.63 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.63 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.4 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  30.59 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  27 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  25.49 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.04 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  26.9 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  25.84 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  22.71 
 
 		 529 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  28.63 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.32 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.91 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.7 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.38 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  24.2 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  30.53 
 
 		 379 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  23.02 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  27.37 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.61 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.61 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.61 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.54 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.3 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.54 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.54 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.54 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.3 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.3 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.54 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.37 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.52 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.92 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.54 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  23.95 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.18 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  24.85 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.84 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.84 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.27 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>