More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3895 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  646    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  41.27 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  39.94 
 
 		 356 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  43.17 
 
 		 364 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  39.44 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  36.34 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  34.95 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  40.42 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  38.44 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  38.41 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  34.28 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  38.1 
 
 		 340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  45.75 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  34.96 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  34.58 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  36.81 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  31.66 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  28.4 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  38.5 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.97 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  37.2 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  32.17 
 
 		 395 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  31.41 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  31.18 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.34 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  29.69 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  31.1 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  29.07 
 
 		 368 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  26.9 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  34.1 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.04 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  25.89 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  26.79 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  26.97 
 
 		 387 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  33.48 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  37.42 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  32.06 
 
 		 369 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  29.49 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  40.64 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  29.65 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.13 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  29.59 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.07 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  28.7 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.3 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.74 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.73 
 
 		 396 aa  96.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  28.76 
 
 		 347 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.16 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.86 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  32.1 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  23.19 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  30.09 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  32.73 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  24.32 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26.5 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.79 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  31.36 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.89 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.8 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  27.3 
 
 		 424 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.4 
 
 		 373 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.32 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  22.89 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.32 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.32 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.52 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.61 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.81 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.32 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  29.44 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.68 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.4 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.4 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  35.23 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  28.4 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  27.71 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.4 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  31 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 455 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  38.43 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  27.82 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  21.87 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  30.16 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  30.86 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  30.86 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  30.86 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>