More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0783 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  678    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  39.82 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  37.2 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  35.05 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  32.55 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  31.53 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.41 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  35.53 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  35.4 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  35.42 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  31.63 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  37.79 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  35.77 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  30.3 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  28.21 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  27.6 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  30.67 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  27.83 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  30.09 
 
 		 372 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  28.09 
 
 		 395 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  39.57 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  31.2 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  37.97 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  27.14 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  30.68 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  32.8 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  33.13 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.97 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.91 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  32.24 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  32.42 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  32.42 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.02 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  27.22 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  27.04 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.42 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.28 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  25.22 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.75 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  29.25 
 
 		 369 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  23.44 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  24.85 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  28.77 
 
 		 460 aa  96.7  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  23.44 
 
 		 366 aa  95.9  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.87 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.32 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  28.06 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.32 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.84 
 
 		 405 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.01 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.01 
 
 		 373 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.01 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.01 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.01 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.01 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.01 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.01 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  33.33 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  26.51 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.48 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  39.41 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  24.85 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  22.06 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  24.55 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.73 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.01 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.53 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.61 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  31.54 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  31.42 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.71 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  39.73 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.55 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.93 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  30.07 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  30.07 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.93 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  30.07 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  30.07 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.93 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  30.07 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  30.07 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.53 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.07 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  29.73 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 439 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 455 aa  86.3  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.23 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  29.5 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>