More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2485 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  80.83 
 
 		 424 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  863    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  47.59 
 
 		 417 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  38.28 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  31.81 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.47 
 
 		 344 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.7 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.28 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  33.02 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.36 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.91 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.48 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  27.88 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  27.88 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  27.88 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  27.88 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  27.88 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.65 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.65 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.18 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.58 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.96 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.83 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.58 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.38 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  30.18 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.21 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  30.21 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  28.18 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.47 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.91 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30.92 
 
 		 387 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.48 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  27.88 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.27 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.17 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.65 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.96 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.2 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.74 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.96 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.55 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.65 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.55 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.87 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  32.58 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  28.16 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  29.32 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.33 
 
 		 529 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.81 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.23 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.73 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.49 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.34 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  26.97 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.85 
 
 		 396 aa  106  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.96 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.98 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  26.97 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  23.73 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  26.99 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.88 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  26.99 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.22 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  25.98 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  29.29 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  30.57 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.61 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.61 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.85 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.24 
 
 		 665 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.61 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.9 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.44 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.97 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  24.7 
 
 		 354 aa  100  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  26.08 
 
 		 542 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.3 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  25.61 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  28.14 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  28.35 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.78 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  28.14 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.61 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  25.61 
 
 		 376 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.27 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>