More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2541 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 392 aa  767    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  32.87 
 
 		 361 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  32.96 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  37.22 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  33.08 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  36.65 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  32.87 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  32.87 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  32.58 
 
 		 361 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  32.58 
 
 		 361 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  32.58 
 
 		 361 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  32.58 
 
 		 361 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  32.58 
 
 		 361 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  36.65 
 
 		 373 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  36.36 
 
 		 373 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  36.36 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  36.36 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  36.36 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  36.36 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  33.24 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  32.37 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  32.37 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  32.94 
 
 		 348 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  32.16 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  34.73 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  32.63 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  32.09 
 
 		 361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.04 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  32.21 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  32.21 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  31.17 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  30.45 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.77 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  31.02 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.5 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  29.69 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  29.57 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  31.86 
 
 		 341 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.45 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.01 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.04 
 
 		 345 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.21 
 
 		 351 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.77 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.71 
 
 		 355 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.71 
 
 		 355 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.4 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 354 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.46 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.51 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  32.91 
 
 		 345 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.19 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.3 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.47 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 345 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.46 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.42 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.15 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  25.83 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  25.49 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.36 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  26.57 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.32 
 
 		 379 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  27.96 
 
 		 353 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.3 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  25.39 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  27.52 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.62 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.98 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.23 
 
 		 375 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.23 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  24.38 
 
 		 665 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  24.79 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.1 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  25.95 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  24.51 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.39 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  26.14 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  26.14 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  26.14 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  26.25 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  24.77 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  25.94 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  25.6 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  26.84 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>