More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1235 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
354 aa  678    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  31.61 
 
 
435 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  30.19 
 
 
417 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  32.01 
 
 
344 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  32.52 
 
 
424 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  30.6 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  32 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  32.22 
 
 
373 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  33.83 
 
 
357 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  32.55 
 
 
400 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  31.02 
 
 
425 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  32.67 
 
 
343 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  31.71 
 
 
361 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  31.71 
 
 
361 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  31.4 
 
 
361 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  30.77 
 
 
361 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.32 
 
 
405 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  31.4 
 
 
348 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  31.1 
 
 
361 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  31.1 
 
 
348 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  31.1 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  30.66 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 
529 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  32.79 
 
 
345 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 
368 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.31 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  31.31 
 
 
351 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  29.58 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  29.68 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.55 
 
 
402 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.55 
 
 
402 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.77 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  30.06 
 
 
412 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  29.43 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  29.43 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  29.78 
 
 
423 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 
438 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.77 
 
 
373 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  29.1 
 
 
376 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  29.1 
 
 
376 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  29.1 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  29.1 
 
 
376 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  29.1 
 
 
373 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  27.78 
 
 
367 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  27.46 
 
 
366 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.1 
 
 
373 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  29.25 
 
 
345 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  27.78 
 
 
368 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 
392 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.07 
 
 
369 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.6 
 
 
372 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  25.93 
 
 
368 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 
354 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.64 
 
 
390 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  28.96 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  27.33 
 
 
348 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  30.14 
 
 
443 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.27 
 
 
387 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  31.21 
 
 
397 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.3 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30.64 
 
 
387 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.01 
 
 
366 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  29.32 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  28.09 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.36 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  28.94 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  27.41 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 
394 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.36 
 
 
383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  30.7 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  28.65 
 
 
415 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.1 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  26.16 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
455 aa  112  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  32.05 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  29.77 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  30.06 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.99 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  28.06 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.96 
 
 
355 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  27.44 
 
 
353 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.97 
 
 
393 aa  110  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.52 
 
 
396 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.28 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.28 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.28 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.28 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.28 
 
 
355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.3 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.3 
 
 
355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 
382 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.46 
 
 
379 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>