More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1751 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1751  permease  100 
 
 		 345 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  32.71 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  29.88 
 
 		 349 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  30.74 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.94 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  28.24 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  30.6 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  30.38 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  30.03 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  30.28 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  30.28 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  30.28 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  30.28 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  30.28 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  29.71 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  29.39 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  28.41 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.68 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.39 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.56 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27.84 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27.84 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27.84 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  28.36 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.94 
 
 		 372 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  27.56 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.06 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  27.56 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.25 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.95 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.8 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.95 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.71 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.36 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.06 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  28.74 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31.38 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.33 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.33 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  29.06 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  34.21 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.08 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.6 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  23.95 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.77 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.08 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.91 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.86 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  26.95 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  27.95 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.94 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  31.92 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.45 
 
 		 405 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  29.69 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.24 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  27.02 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  27.02 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  28.28 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  27.02 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  27.4 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.97 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  27.02 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  27.02 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  25.35 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  29.49 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.92 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.84 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.84 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.56 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  26.78 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  26.78 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  26.78 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.02 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  31.17 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  29.55 
 
 		 357 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>