More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1352 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
438 aa  875    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  40.53 
 
 
386 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  39.83 
 
 
403 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  38.82 
 
 
407 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  36.34 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.79 
 
 
343 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  28.73 
 
 
404 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.67 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 
344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.79 
 
 
355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.56 
 
 
390 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.16 
 
 
361 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.47 
 
 
355 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.14 
 
 
363 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.65 
 
 
374 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.58 
 
 
379 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.15 
 
 
349 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.8 
 
 
396 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 
353 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  27.61 
 
 
351 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.84 
 
 
373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.84 
 
 
345 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  24.43 
 
 
378 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.74 
 
 
417 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.95 
 
 
375 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.53 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.53 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.53 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.53 
 
 
361 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  26.51 
 
 
348 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.53 
 
 
348 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.95 
 
 
358 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.53 
 
 
348 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.53 
 
 
361 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.53 
 
 
361 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  26.12 
 
 
368 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  26.55 
 
 
368 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 
349 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.63 
 
 
367 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.91 
 
 
361 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  24.59 
 
 
398 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 
350 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.74 
 
 
423 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.77 
 
 
405 aa  100  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.53 
 
 
402 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.53 
 
 
402 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.71 
 
 
388 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  27.68 
 
 
354 aa  99  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24.56 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  24.54 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  25.47 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  29.81 
 
 
487 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0071  protein of unknown function UPF0118  23.61 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.15 
 
 
393 aa  97.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.84 
 
 
355 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  25.24 
 
 
357 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  27.03 
 
 
382 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 
358 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  24.43 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  25.47 
 
 
356 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  24.64 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.45 
 
 
345 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  23.75 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 
397 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  25.54 
 
 
356 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  28.12 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  26.95 
 
 
365 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  27.03 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.38 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.72 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  24.93 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.7 
 
 
379 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  27.33 
 
 
394 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  25.42 
 
 
357 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  31.16 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  27.62 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  24 
 
 
382 aa  90.5  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.12 
 
 
665 aa  90.9  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.63 
 
 
389 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  26.69 
 
 
366 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  28.64 
 
 
382 aa  90.5  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  25.7 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  25.2 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 
370 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  25.84 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>