More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1236 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
439 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  71.99 
 
 
457 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  50.51 
 
 
455 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  47.34 
 
 
487 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  46.37 
 
 
423 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  51.43 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  49.28 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  42.36 
 
 
452 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  46.05 
 
 
381 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  46.05 
 
 
381 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  46.05 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  49.86 
 
 
384 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  52.14 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  49.15 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  48.12 
 
 
402 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  42.24 
 
 
464 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  46.49 
 
 
483 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  42.01 
 
 
477 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  46.11 
 
 
403 aa  256  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  45.59 
 
 
390 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  42.21 
 
 
421 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  44.01 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.27 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  45.95 
 
 
396 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  46.8 
 
 
475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  40.19 
 
 
367 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  39.27 
 
 
407 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  35.06 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  39.29 
 
 
423 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34.96 
 
 
429 aa  193  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  36.93 
 
 
397 aa  189  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  38.32 
 
 
389 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  39.35 
 
 
384 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.11 
 
 
368 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.23 
 
 
436 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  40.87 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  35.93 
 
 
418 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  35.23 
 
 
476 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  38.85 
 
 
376 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  38.64 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.65 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  39.53 
 
 
376 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  39.53 
 
 
376 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  36.66 
 
 
394 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  34.82 
 
 
398 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  37.25 
 
 
390 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.45 
 
 
435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.67 
 
 
432 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  31.87 
 
 
441 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  33.51 
 
 
414 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  39.72 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  38.4 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.69 
 
 
355 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.39 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.28 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.9 
 
 
383 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.63 
 
 
436 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.8 
 
 
393 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.03 
 
 
384 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 
369 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.34 
 
 
371 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 
354 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  26.46 
 
 
390 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.03 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  27.05 
 
 
368 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.55 
 
 
529 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  30.95 
 
 
369 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.78 
 
 
373 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.56 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.56 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.56 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.56 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.56 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.78 
 
 
361 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.33 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.25 
 
 
355 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.21 
 
 
361 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.63 
 
 
341 aa  94  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.75 
 
 
348 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  32.02 
 
 
340 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  28.21 
 
 
360 aa  93.2  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.21 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.21 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.78 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.78 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.21 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.84 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.92 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  30.41 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.17 
 
 
348 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.02 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.95 
 
 
329 aa  91.3  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.84 
 
 
400 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  26.86 
 
 
460 aa  90.1  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.21 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 
364 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.13 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>