More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3105 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  73.31 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  47.8 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  54.67 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  38.48 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  37.68 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  37.39 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  37.39 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  38.96 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  40.55 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  39.72 
 
 		 367 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  38.34 
 
 		 423 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  37.87 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  37.98 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  39.06 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  37.8 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  36.6 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  41.72 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  41.32 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  41.4 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  41.4 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  36.1 
 
 		 455 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  39.87 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  36.22 
 
 		 436 aa  179  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  35.91 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  39.1 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  39.52 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  36.36 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  40.14 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34.08 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  34.64 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  39.56 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  38.11 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  40.73 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  34.77 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  38.32 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  36.42 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  32.97 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  36.15 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  34.64 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  34.95 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  38.01 
 
 		 483 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  35.16 
 
 		 476 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.79 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  37.75 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  33.62 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  36.04 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.24 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  37.74 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  33.87 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  37.79 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  33.55 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  41.97 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.92 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  28.36 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.97 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  28.06 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  30.68 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  29.41 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  27.76 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  29.41 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  29.41 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  29.72 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.62 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.78 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.77 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  29.46 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  27.1 
 
 		 412 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 397 aa  93.2  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  27.91 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.84 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.25 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  28.48 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  27.3 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.86 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.93 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  29.13 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  28.04 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  25.33 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  27.46 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  25.33 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  23.56 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  33.1 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.79 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  25.41 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.58 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  25.68 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>