More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3065 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  664    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  71.93 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  56.18 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  33.72 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  32.7 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  34.03 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  31.66 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  33.24 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  32.04 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  31.5 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  33.02 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  30.79 
 
 		 358 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  33.02 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  33.02 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  33.02 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  32.72 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  33.13 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  33.13 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  33.13 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  32.27 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  34.51 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  30.75 
 
 		 389 aa  165  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  33.04 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  30.31 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  31.02 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  31.66 
 
 		 350 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  30.77 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  30.61 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  30.61 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  30.61 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  30.14 
 
 		 350 aa  152  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  27.14 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1524  protein of unknown function UPF0118  30.12 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0907  hypothetical protein  32 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0785187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  27.71 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  28.44 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  28.01 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  28.44 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  28.99 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  27.71 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  27.71 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  27.71 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  28.99 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  28.99 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  29.45 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  28.99 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  27.71 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  26.96 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  28.66 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1291  hypothetical protein  28.7 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0482108  normal  0.0196495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  30.23 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3357  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.53694  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  28.33 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1134  hypothetical protein  30.03 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7304  hypothetical protein  27.84 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  24.78 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  27.37 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  26.95 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  29.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  29.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  29.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  29.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  29.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  29.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  29.64 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  23.73 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  29.32 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  29.32 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  28.86 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  28.86 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  24.84 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.08 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4918  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  24.23 
 
 		 385 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  24.43 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  23.7 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  28.16 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  25.71 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  22.44 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1025  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.297957 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  22.64 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  22.89 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  33.11 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  24.13 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1957  hypothetical protein  24.81 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654804  normal  0.114361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>