More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0793 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  51.39 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  48.82 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  47.4 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  45.07 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2449  hypothetical protein  40.88 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00490145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  28.53 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  28.61 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  28.53 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  30.56 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  30.73 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  28.53 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  28.53 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  26.38 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  28.45 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  28.37 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  28.37 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  28.37 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  27.58 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  27.95 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  30.03 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  44.27 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  44.27 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  28.91 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  27.06 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  28.46 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1957  hypothetical protein  28.99 
 
 		 354 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654804  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  29.85 
 
 		 341 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  24.36 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  27.73 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  37.5 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  27.17 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  29.46 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  31.87 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  26.7 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  32.11 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  37.82 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  26.84 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  28.29 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  26.41 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  26.71 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  32.14 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  25.58 
 
 		 347 aa  95.9  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  29.18 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  29.18 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  27.51 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  29.18 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  29.18 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  29.18 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  29.18 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  30.97 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  30.97 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  30.97 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  37.58 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  27.46 
 
 		 368 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  27.93 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  28.82 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  30.53 
 
 		 369 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2517  hypothetical protein  26.44 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.06 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  29.26 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  26.33 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  32.05 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  29.96 
 
 		 406 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  24.86 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  32.14 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  25.43 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26.98 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2398  hypothetical protein  27.14 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.17382  normal  0.699282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  26.27 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  24.36 
 
 		 782 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  27.6 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  26.27 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  25.89 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  25.89 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  25.89 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  23.18 
 
 		 644 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3065  hypothetical protein  33.11 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.499692  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3954  inner membrane protein YhhT  28.82 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  22.44 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  26.28 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  32.09 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0359  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17593  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  32.21 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  32.21 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  32.21 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  26.92 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  34.19 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  23.56 
 
 		 801 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>