More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1228 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1228  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0793  hypothetical protein  51.39 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1044  protein of unknown function UPF0118  51.39 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5234  hypothetical protein  47.15 
 
 
362 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3619  hypothetical protein  48.63 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542852  normal  0.0156067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2449  hypothetical protein  42.11 
 
 
338 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00490145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  26.25 
 
 
336 aa  119  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  37.28 
 
 
414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  37.28 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  37.65 
 
 
390 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  24.33 
 
 
339 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2014  hypothetical protein  40.65 
 
 
352 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2009  hypothetical protein  40.65 
 
 
352 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  25.97 
 
 
360 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 
358 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1957  hypothetical protein  29.34 
 
 
354 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654804  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.89 
 
 
359 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3864  hypothetical protein  32.18 
 
 
356 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285096  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  25.9 
 
 
344 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3908  hypothetical protein  29.45 
 
 
383 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  25.9 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  25.9 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  25.9 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  25.9 
 
 
344 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  26.38 
 
 
354 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2437  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.705178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 
359 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  28.91 
 
 
359 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  26.15 
 
 
344 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  27.68 
 
 
338 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  24.66 
 
 
663 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  36.13 
 
 
405 aa  96.3  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  25.43 
 
 
370 aa  95.9  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  24.46 
 
 
644 aa  95.9  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  27.13 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3090  putative transport protein  28.28 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  24.85 
 
 
347 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  27.13 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  25.46 
 
 
824 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 
679 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  24.14 
 
 
668 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23200  predicted permease  26.41 
 
 
398 aa  92.8  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4788  hypothetical protein  33.55 
 
 
373 aa  92.8  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  23.43 
 
 
662 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  25.71 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  25.71 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  23.37 
 
 
805 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  25.71 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  23.36 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  26.8 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  25.33 
 
 
830 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  26.02 
 
 
438 aa  90.1  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  33.99 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  24.17 
 
 
662 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  32.47 
 
 
434 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  24.63 
 
 
345 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  33.55 
 
 
389 aa  86.7  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  31.37 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  25.59 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 
650 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1889  putative transport protein  38.1 
 
 
350 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  33.99 
 
 
394 aa  85.9  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  31.65 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26.95 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 
675 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1598  putative transport protein  33.12 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0006  membrane protein  32.72 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  30.86 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01570  predicted inner membrane protein  33.12 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2042  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1787  putative transport protein  33.12 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.619529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01560  hypothetical protein  33.12 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1675  putative transport protein  33.12 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2029  putative transport protein  33.12 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.854402  normal  0.642454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2311  putative transport protein  33.12 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.24 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3067  hypothetical protein  27.59 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722131  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  22.29 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1808  putative transport protein  33.12 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3851  inner membrane protein YhhT  30.99 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  28.43 
 
 
653 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1937  permease-like protein  33.7 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  24.57 
 
 
659 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  25.59 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3035  hypothetical protein  22.55 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.124885  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  25 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  33.57 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  25.82 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  25.29 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  25.37 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3894  hypothetical protein  30.41 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3784  inner membrane protein YhhT  30.41 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  22.9 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  24.23 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3774  inner membrane protein YhhT  30.41 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.505829  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  22.9 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2140  hypothetical protein  27.42 
 
 
700 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425167  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2910  hypothetical protein  25.14 
 
 
660 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>