More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7599 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  45.33 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  44.12 
 
 		 441 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  36.36 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  38.2 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.89 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  34.47 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  34.47 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.47 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  34.05 
 
 		 487 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  34.33 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  34.2 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  36.11 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  35.8 
 
 		 455 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  35.83 
 
 		 421 aa  155  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  33.24 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  34.36 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  30.96 
 
 		 407 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.88 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  37.4 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  33.24 
 
 		 397 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  34.94 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  35.04 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  38.51 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  34.38 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  31.81 
 
 		 464 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  31.27 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  33.63 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  34.05 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  34.86 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.4 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  32.25 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  36.78 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  35.59 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  34.51 
 
 		 415 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  33.87 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  35.56 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  43.01 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.94 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  33.44 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  33.89 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  33.89 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  31.17 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  32.06 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.63 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  30.49 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.95 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  31.37 
 
 		 405 aa  115  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  29.59 
 
 		 398 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  32.92 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  29.65 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  30.55 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  43.75 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 529 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.71 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  29.35 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 400 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.77 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.18 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  31.02 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  31.02 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.18 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.36 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  28.21 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  30.36 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  30.36 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.06 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  29.87 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  32.65 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.33 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.76 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  33.63 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  26.83 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.95 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.08 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.29 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.33 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  25.48 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.32 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.32 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.53 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  30.37 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  29.58 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.54 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.61 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.02 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  24.65 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.2 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  29.9 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  27.19 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  27.07 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  25.69 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  25.89 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>