More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0221 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 364 aa  721    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  74.48 
 
 		 448 aa  484  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  61.61 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  58.13 
 
 		 455 aa  421  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  44.15 
 
 		 526 aa  312  5.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  45.22 
 
 		 563 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  39.24 
 
 		 408 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  38.96 
 
 		 414 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  40.76 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 386 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 529 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.9 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.55 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  32.87 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  31.46 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  30.17 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  25.95 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  30.59 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  29.62 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  27.96 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  26.64 
 
 		 487 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  27.96 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  27.87 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.69 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.47 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  27.96 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 397 aa  89.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  30.67 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  26.9 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  29.84 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  29.24 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.6 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  26.95 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.6 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.76 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.52 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.14 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  25.7 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  25.34 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  25.7 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.14 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.14 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.14 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.62 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.79 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.27 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  22.06 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  23.58 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.68 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  25.85 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  26.53 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  25.89 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  24.92 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19450  predicted permease  26.49 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  24.92 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  23.73 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  25.64 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.64 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  25.32 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  25.86 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.45 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  24.92 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  29.3 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.47 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25.24 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  27.95 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  24.56 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.08 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  26.34 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  23.84 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.38 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  24.21 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.42 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  25.82 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  23.51 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>