More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2284 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 406 aa  779    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  39.51 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  39.8 
 
 		 423 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  38.53 
 
 		 392 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 		 529 aa  215  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  36.93 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  37.97 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  37.03 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  37.25 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  37.27 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  35.33 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  33.81 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  35.2 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  31.76 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  35.34 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  32.47 
 
 		 448 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  29.36 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  30.03 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 400 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  31.81 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  30.51 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08230  predicted permease  36.95 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.93 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.52 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.15 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  27.87 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  27.35 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  28.12 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  28.2 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  27.39 
 
 		 350 aa  90.1  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 		 436 aa  89.7  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.67 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.89 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.1 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.07 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  23.93 
 
 		 526 aa  88.2  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  28.52 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  27.08 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2778  hypothetical protein  27.78 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0204087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1685  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  29.17 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2681  hypothetical protein  27.78 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.185142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2702  hypothetical protein  27.43 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00759105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  30.4 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  30.11 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  27.99 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  28.33 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  28.33 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  28.17 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  28.17 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  23.62 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  22.33 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.08 
 
 		 355 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.44 
 
 		 358 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.77 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  28.28 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  26.85 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  25.91 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  29.93 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.77 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.77 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  24.7 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.26 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2386  hypothetical protein  26.04 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0461614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.67 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.9 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  34.41 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  30.48 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  29.44 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  24.75 
 
 		 563 aa  79.7  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  22.83 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  29.55 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.08 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.54 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  24.06 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  26.75 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.84 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  28.53 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>