More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2203 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 397 aa  776    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  54.83 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  48.79 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  50.55 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  37.72 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  40.38 
 
 		 487 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  39.38 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  38.32 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  38.32 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  38.32 
 
 		 381 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  39.81 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  39.24 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  39.87 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  39.6 
 
 		 420 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  38.22 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  38.24 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.61 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  39.46 
 
 		 452 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  35 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  36.66 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  36.93 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  36.68 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  36.09 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  36.68 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  37.34 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  38.54 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  35.34 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  36.03 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  37.58 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  38.28 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  36.95 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  36.21 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  34.86 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  41.73 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.81 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  38.61 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.58 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  37.97 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  38.16 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  35.8 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  37.25 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  37.83 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  39.67 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  31.94 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  37.62 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  38.8 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.97 
 
 		 476 aa  133  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.59 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  31.33 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.57 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  34.48 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  40.98 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  39.81 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.28 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 		 529 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 455 aa  109  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  29.36 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.92 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  25.66 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.53 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  30.04 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  27.02 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.34 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.97 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  25.8 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  31.8 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  26.95 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.37 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.89 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.89 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.37 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.89 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.57 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  30 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  23.33 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.89 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  27.08 
 
 		 407 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.57 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.94 
 
 		 343 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.57 
 
 		 348 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  29.96 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  27 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  26.52 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  26.58 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.75 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.6 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  35.39 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.53 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  23.64 
 
 		 403 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.88 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.91 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  23.75 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  24.51 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  26.15 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  26.91 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.03 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  32.95 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>