More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  100 
 
 		 476 aa  929    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  44.42 
 
 		 426 aa  328  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  50.42 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  48.91 
 
 		 376 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  48.91 
 
 		 376 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  47.14 
 
 		 394 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  46.68 
 
 		 414 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  44.73 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  41.88 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  42.28 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  48.29 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  33.25 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  35.45 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.71 
 
 		 439 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  33.6 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  35.51 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  36.02 
 
 		 455 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  35.22 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  32.73 
 
 		 397 aa  172  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.05 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  37.54 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  37.71 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  33.24 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  33.87 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  33.87 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.87 
 
 		 381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  34.2 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.86 
 
 		 389 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  32.54 
 
 		 407 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  29.62 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  37.82 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  33.24 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  33.93 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  33.14 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  34.98 
 
 		 441 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  29.94 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  36.15 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  32.34 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 		 398 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  34.16 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  31.52 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.81 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  33.33 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  30.11 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  30.88 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  30.64 
 
 		 367 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  36.02 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36.94 
 
 		 393 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  33.43 
 
 		 355 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  32.79 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  30.45 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  36.6 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 460 aa  110  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.8 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  26.77 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.48 
 
 		 369 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.64 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.8 
 
 		 345 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  28.68 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 		 358 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.28 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  22.7 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 		 372 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  28.63 
 
 		 563 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 373 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  26.12 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  32.74 
 
 		 392 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.74 
 
 		 371 aa  90.1  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 354 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.46 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  23.44 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  23.31 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  29.97 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.84 
 
 		 375 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  21.66 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.84 
 
 		 369 aa  87.8  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.1 
 
 		 370 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  28.57 
 
 		 388 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  25.79 
 
 		 386 aa  87  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 376 aa  87  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  26.84 
 
 		 358 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  24.92 
 
 		 357 aa  86.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.54 
 
 		 343 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.4 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  27.72 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.38 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  24.42 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  28.25 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  23.16 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.52 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>