More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1895 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 483 aa  957    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  58.73 
 
 		 455 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  59.45 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  55.74 
 
 		 421 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  41.94 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  45.1 
 
 		 487 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  37.83 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  43.58 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  42.36 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  43.98 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  45.76 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  43.1 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  43.1 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  43.1 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  40.56 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  42.22 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  39.11 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  47.02 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  41.28 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  38.87 
 
 		 402 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  38.53 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  39.73 
 
 		 415 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  39.63 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  45.52 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  40.88 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  34.8 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  39.32 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.84 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  36.34 
 
 		 423 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  36.8 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  38.29 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  34.98 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  37.67 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  36.28 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  30.14 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  36.36 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  32.97 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.94 
 
 		 389 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  37.57 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  36.22 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.82 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  34.85 
 
 		 376 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  34.25 
 
 		 394 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  37.4 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  37.4 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  35.73 
 
 		 414 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  34.46 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  38.82 
 
 		 384 aa  143  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  34.55 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  36.88 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  35.58 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  39.62 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  41.11 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.57 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.44 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.44 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  32.01 
 
 		 354 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  31.42 
 
 		 369 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  34.24 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  27.13 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 436 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  35.43 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.16 
 
 		 363 aa  97.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.59 
 
 		 371 aa  94.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.13 
 
 		 383 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.02 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.25 
 
 		 370 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.22 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.7 
 
 		 361 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  87.4  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 351 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.93 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.69 
 
 		 368 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  26.35 
 
 		 429 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.64 
 
 		 373 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  22.61 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.64 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.85 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.15 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.55 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.85 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.85 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  27.94 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  24.71 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  24.02 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.79 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.46 
 
 		 358 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.12 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.28 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.52 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.49 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>