More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0978 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  875    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  47.18 
 
 		 487 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  47.34 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  50.59 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  41.51 
 
 		 457 aa  262  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  43.8 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  43.11 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  43.96 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  43.91 
 
 		 421 aa  255  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  44.48 
 
 		 421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  43.71 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  42.3 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  43.71 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  43.71 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  43.43 
 
 		 415 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  42.71 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  44.88 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  46.81 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  46.82 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  43.98 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  45.43 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  36.69 
 
 		 477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  41.09 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  41.26 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  35.35 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  35.8 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  35.71 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  32.49 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  39.37 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.41 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  35.19 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  36.99 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  34.88 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  32.04 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  36.14 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  31.59 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  36.68 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  37.41 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  37.41 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  39.51 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  36.25 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  35.33 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  33.73 
 
 		 416 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  34.08 
 
 		 476 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  39.01 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  35.06 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  30.19 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.29 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  37.57 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  30.95 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.33 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  41.82 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  34.53 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  30.56 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.39 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.44 
 
 		 390 aa  103  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1387  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.03 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.03 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  27.56 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  30.58 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.92 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.8 
 
 		 354 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.65 
 
 		 343 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  27.21 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.18 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.1 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.96 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.25 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.56 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  25.08 
 
 		 345 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  30.52 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  29.26 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  24.39 
 
 		 393 aa  87  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.82 
 
 		 388 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.45 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.02 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.81 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.93 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.93 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.15 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.06 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.38 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.21 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>