More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2286 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 418 aa  818    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  62.07 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  58.4 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  53.22 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  43.65 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  36.09 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  33.25 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  36.89 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  36.36 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  34.77 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  35.38 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  34.22 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  36.47 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  31.59 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  34.31 
 
 		 367 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  32.79 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  35.11 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  34.78 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.64 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  33.82 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  34.4 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  33.82 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.82 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  36.06 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  34.08 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.04 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  32.18 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  34.72 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  36.75 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  35.52 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  36.9 
 
 		 384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  35.57 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  34.24 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  35.05 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  42.16 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  30.82 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  33.66 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  31.63 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  33.45 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  30.45 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  33.09 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  33.09 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  32.25 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  31.71 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  32.74 
 
 		 432 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.06 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.5 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  29.65 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 		 529 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.71 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.59 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  26.91 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  26.07 
 
 		 386 aa  86.3  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  29.87 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  30.58 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  29.81 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  27.8 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.53 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.66 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.63 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  27.85 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.67 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  28 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.71 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.95 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.94 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.62 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  23.7 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  29.24 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25.16 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  28.98 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  24.92 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.88 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>