More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2165 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  813    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  70.79 
 
 		 408 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15290  predicted permease  42.51 
 
 		 415 aa  262  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  39.33 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  42.2 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  40.11 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  39.53 
 
 		 364 aa  236  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  35.65 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  38.06 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  35.84 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  33.96 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  31.32 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  32.24 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  30.13 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  28.93 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  31.58 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.45 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  29.51 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  28.46 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.1 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  27 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  27 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  27 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.37 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.86 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.86 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  30.27 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  32.14 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  30.27 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 354 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  30.56 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  29.29 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  27.71 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  32.17 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  36.89 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.04 
 
 		 394 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  27.19 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  27.86 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  27.86 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  27.86 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  30.15 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2284  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  29.25 
 
 		 477 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 		 486 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.67 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.5 
 
 		 371 aa  93.2  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.7 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  24.44 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.58 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.87 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  27 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  27.98 
 
 		 418 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  26.53 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.24 
 
 		 345 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  27.46 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.69 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  22.35 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  21.78 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  28.93 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  27.43 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  27.87 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  24.62 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  23.61 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.58 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  30.9 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  28.25 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  23.33 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.75 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  24.45 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  29.09 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  24.9 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  30.9 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.92 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  27.34 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  23.72 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.98 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.37 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.42 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.72 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  25.99 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.71 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>