More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0908 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  686    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  54.39 
 
 		 369 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  33.11 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  29.11 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  29.97 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  26.95 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  28.74 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  32.98 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  25.59 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  24.6 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  24.6 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  30.79 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  31.05 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  32.63 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  27.51 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  30.08 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  24.52 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  28.75 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  32.5 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  23.64 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  32.14 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  28.48 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  32.39 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  26.92 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.12 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  32.39 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  27.12 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  30.34 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  28.5 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  26.07 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  26.69 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.14 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  29.66 
 
 		 529 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.76 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  31.46 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  31.46 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  31.46 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  31.46 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  26.67 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  29.89 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.42 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.91 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  30.95 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  26.67 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  27.3 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  27.5 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  28.27 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  29.03 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  27.8 
 
 		 360 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  22.86 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  26.09 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  28.92 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  24.04 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.7 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.85 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  22.55 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  27.08 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  26.82 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  30.92 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  29.74 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  29.74 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  29.74 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  29.74 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  24.64 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  29.74 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  29.74 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.95 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.41 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  29.74 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  27.46 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.1 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  25.37 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  25.99 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  25.99 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  29.59 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.9 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  25.99 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>