More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2750 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2750  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  622  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  31.23 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  31.17 
 
 		 372 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  36.92 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  28.85 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.44 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  30.98 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  34.91 
 
 		 376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  34.31 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  32.18 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.69 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  34.32 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.18 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.18 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  28.12 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.09 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.16 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.16 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.68 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.84 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  31 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.35 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  28.05 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.68 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  30.91 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  37.36 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  36.78 
 
 		 434 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  33.64 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.28 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  28.02 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.06 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  29.1 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  27.6 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  35.91 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.3 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  26.23 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  32.01 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  28.72 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  26.2 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  28.29 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  29.87 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  31.14 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.38 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  26.2 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  28.92 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  28.51 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.52 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.72 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  32.76 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  32.76 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  32.76 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.38 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  23.53 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.87 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  30.82 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  32.61 
 
 		 384 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  24.44 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  29.14 
 
 		 652 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  28.3 
 
 		 415 aa  89.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  29.35 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 		 529 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  27.88 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.45 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  32.82 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 		 652 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  29.74 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  29.44 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  32.82 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  29.44 
 
 		 375 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  27.01 
 
 		 365 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 649 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  29.77 
 
 		 455 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  31.44 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.5 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  31.21 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  32.59 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  30.04 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>