More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8661 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 386 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  47.63 
 
 		 408 aa  325  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  47 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  36.1 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  34.95 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  34.95 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  33.83 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  31.37 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  30.18 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  33.6 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  32.07 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  33.62 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  33.53 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  32.07 
 
 		 369 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  31.79 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  31.78 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  31.64 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  33.33 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  31.23 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  31.52 
 
 		 393 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  31.88 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  32.63 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  32.8 
 
 		 444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  31.9 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  31.44 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  32.44 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  31.7 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  30 
 
 		 393 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  29.66 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  29.41 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  31.27 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  29.95 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  33.79 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  28 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  29.51 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  27.19 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.71 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  27.61 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  30.2 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  26.15 
 
 		 606 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  25.97 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  25.13 
 
 		 668 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  26.04 
 
 		 805 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  25.13 
 
 		 679 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 650 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 387 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 662 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  28.61 
 
 		 821 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 		 675 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  27.86 
 
 		 659 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  26.89 
 
 		 649 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  26.11 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2482  hypothetical protein  26.06 
 
 		 662 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3553  hypothetical protein  27.27 
 
 		 647 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625218 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0719  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000137163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  23.31 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  26.22 
 
 		 644 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3659  hypothetical protein  30.16 
 
 		 390 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0638108 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4370  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 		 652 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  26.09 
 
 		 801 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  30.56 
 
 		 414 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  31.61 
 
 		 653 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  26.7 
 
 		 651 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3566  hypothetical protein  26 
 
 		 657 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  26.34 
 
 		 830 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  25 
 
 		 652 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  30.56 
 
 		 432 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  24.38 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  27.03 
 
 		 651 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  25.54 
 
 		 824 aa  86.3  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1150  hypothetical membrane spanning protein  24.73 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  23.29 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.92 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 		 652 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1020  hypothetical protein  25.15 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0336  hypothetical protein  26.2 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.115948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  30.34 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  25 
 
 		 782 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  27.32 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  26.84 
 
 		 645 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  23.01 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2379  hypothetical protein  24.77 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  24.7 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  23.41 
 
 		 663 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  25.5 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  25.5 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  25.5 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3145  hypothetical protein  24.53 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>