More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2059 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2059  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  750    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.295344  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2214  hypothetical protein  73.7 
 
 
374 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3144  hypothetical protein  37.39 
 
 
393 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0744058  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2954  hypothetical protein  36.65 
 
 
444 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3116  membrane transporter  38.18 
 
 
388 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3845  hypothetical protein  38.18 
 
 
406 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521345  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  33.07 
 
 
385 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5963  protein of unknown function UPF0118  36.18 
 
 
353 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.97133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2158  hypothetical protein  33.07 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3520  hypothetical protein  34.86 
 
 
434 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2995  hypothetical protein  28.69 
 
 
377 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8661  protein of unknown function UPF0118  30.1 
 
 
386 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  28.05 
 
 
356 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1983  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  28.5 
 
 
393 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  29.15 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  27.42 
 
 
394 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  29.53 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3105  hypothetical protein  29.19 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  26.87 
 
 
374 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3464  hypothetical protein  27.27 
 
 
406 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4026  hypothetical protein  30.47 
 
 
374 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  29.27 
 
 
390 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6996  putative permease  28.03 
 
 
372 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  27.39 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02869  transport protein  26.61 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1390  hypothetical protein  29.09 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  26.55 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 
420 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1370  hypothetical protein  27.85 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.635669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01555  transport protein  31.66 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1381  hypothetical protein  26.54 
 
 
384 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2143  hypothetical protein  25.93 
 
 
366 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0992  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
396 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.537691  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1194  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
359 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.514771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4702  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
371 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0484  hypothetical protein  25.14 
 
 
406 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1509  hypothetical protein  28.73 
 
 
399 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0246  transport protein  25.46 
 
 
369 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.33291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  26.4 
 
 
359 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1260  hypothetical protein  26.97 
 
 
366 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 
359 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0864  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 
388 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407336  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 
389 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2430  hypothetical protein  26.53 
 
 
360 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  26.84 
 
 
663 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0216  hypothetical protein  25.15 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2158  protein of unknown function UPF0118  26.99 
 
 
653 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.02 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  25.59 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4175  hypothetical protein  27.1 
 
 
339 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0228535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 
383 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  22.85 
 
 
371 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3776  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 
439 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2954  hypothetical protein  27.53 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3888  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 
439 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1860  putative transport protein  26.35 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  27.15 
 
 
647 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  26.35 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3345  hypothetical protein  27.88 
 
 
432 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1590  putative transport protein  26.35 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1581  putative transport protein  26.35 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2920  hypothetical protein  23.45 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2909  hypothetical protein  24.03 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1490  hypothetical protein  24 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00480126  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2996  hypothetical protein  27.52 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.229433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  24.22 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  26.06 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02299  hypothetical protein  25.16 
 
 
345 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.622561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2065  protein of unknown function UPF0118  25.34 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  27.04 
 
 
344 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  24.25 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1544  hypothetical protein  23.26 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173707  normal  0.127911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3848  hypothetical protein  22.75 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1324  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0575147  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  22.84 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 
652 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  23.17 
 
 
354 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  25.14 
 
 
352 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  25.14 
 
 
352 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  25.14 
 
 
352 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  22.46 
 
 
349 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2557  hypothetical protein  23.59 
 
 
404 aa  86.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  25.07 
 
 
652 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03323  predicted inner membrane protein  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0241  protein of unknown function UPF0118  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  23.46 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5379  protein of unknown function UPF0118  24.4 
 
 
650 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.613329  normal  0.237029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1485  hypothetical protein  23.26 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00467252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1550  hypothetical protein  23.26 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0232271  normal  0.172747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  22.29 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3956  hypothetical protein  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  24.44 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0242  hypothetical protein  22.46 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 
649 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  24.15 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>