More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3538 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  778    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  84.33 
 
 		 412 aa  625  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.15 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.75 
 
 		 349 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.8 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.59 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 		 344 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  22.92 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.32 
 
 		 341 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  26.65 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  25.34 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  25.47 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  28.43 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.43 
 
 		 358 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  32.54 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  32.54 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  32.82 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  25.17 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.18 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  31.15 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  20.9 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.61 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.99 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  25.5 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.42 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.14 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.15 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  26.01 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  28.47 
 
 		 356 aa  86.3  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.36 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  23.61 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  24.38 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.53 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.19 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.3 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  29.33 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  24.15 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.4 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.51 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  24.67 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  23.57 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.3 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  26.53 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.61 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  21.81 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  26.17 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.72 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.29 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.5 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.58 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.58 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.58 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.58 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.58 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.58 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.25 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.25 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  26.47 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  21.86 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.16 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  23.38 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  28.33 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  26.57 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.96 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.32 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  23.05 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  24.57 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  28.11 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.28 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  24.24 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  23.81 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  24.05 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.42 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.71 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.2 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  28.76 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  27.03 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  24.41 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  30.32 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  29.55 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.92 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.64 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  23.94 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  25.91 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  26.87 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>