More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2702 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  47.84 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  48.61 
 
 
373 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  42.15 
 
 
367 aa  288  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  44.05 
 
 
390 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  40.54 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  41.61 
 
 
390 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  41.27 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  40.06 
 
 
350 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  39.36 
 
 
397 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  36.83 
 
 
362 aa  248  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  40.56 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  37.69 
 
 
365 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  39.69 
 
 
360 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  39.69 
 
 
360 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  37.03 
 
 
377 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  37.27 
 
 
354 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  40.73 
 
 
355 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  36.62 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  30.77 
 
 
345 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  30.3 
 
 
356 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  29.28 
 
 
361 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 
358 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  28.66 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.05 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  28.86 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2772  protein of unknown function UPF0118  27.02 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.43 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.69 
 
 
415 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.81 
 
 
379 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.42 
 
 
369 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  29.64 
 
 
382 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 
374 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  29.32 
 
 
382 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.9 
 
 
398 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  28.14 
 
 
378 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.68 
 
 
351 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.91 
 
 
396 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 
374 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  24.61 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.25 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.27 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  24.86 
 
 
355 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  24.86 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  24.86 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  24.86 
 
 
362 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  24.86 
 
 
355 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.51 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.38 
 
 
341 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  26.2 
 
 
382 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  25.79 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.15 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  24.24 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 
452 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.85 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  27.47 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.81 
 
 
364 aa  89.7  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.87 
 
 
390 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  26.45 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.98 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  26.9 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.71 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.3 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  22.7 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.58 
 
 
354 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  27.08 
 
 
434 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.75 
 
 
358 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.75 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  26.52 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  26.53 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  27.85 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  26.95 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.18 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  27.52 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  24.53 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  24.53 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
529 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  24.53 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  27.18 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  26.17 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  22.4 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  22.4 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.15 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.15 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.15 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.15 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.15 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  26.63 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.73 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>