More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2421 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2421  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.721488  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2101  hypothetical protein  78.61 
 
 
363 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27111  hypothetical protein  71.26 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  41.28 
 
 
350 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  42.33 
 
 
360 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  42.33 
 
 
360 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  33.9 
 
 
365 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  35.38 
 
 
373 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  35 
 
 
362 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  30.15 
 
 
367 aa  179  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  32.12 
 
 
390 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  29.97 
 
 
353 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  35.26 
 
 
364 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  34.05 
 
 
397 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  30.97 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  32.39 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  32.45 
 
 
387 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  30.38 
 
 
365 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1341  hypothetical protein  34.27 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  30.91 
 
 
377 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1877  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 
355 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0823  hypothetical protein  32.23 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 
354 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.5 
 
 
345 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.04 
 
 
438 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
358 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  30.4 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.03 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  23.71 
 
 
377 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.59 
 
 
375 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  27.59 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  26.56 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  27.38 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.88 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.88 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.88 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.88 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  28.74 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.88 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  24.29 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.71 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  24.63 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  22.57 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.76 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  27.27 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.95 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  22.61 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.05 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  26.71 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  21.84 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  28.93 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  21.47 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.5 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  26.8 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  21.36 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  28.53 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  22.91 
 
 
391 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  21.91 
 
 
403 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.12 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  25.64 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.15 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  23.1 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  24.94 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  25.8 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  24.58 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  25.6 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  25.08 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  26.87 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  24.68 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  21.04 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  22.12 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  20.92 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  22.68 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  28.9 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.01 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.01 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.69 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.67 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  21.36 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.54 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  24.46 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  21.07 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.45 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.94 
 
 
415 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  27.58 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  21.07 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.2 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  21.68 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  21.07 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  21.07 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  28.08 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  21.07 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>