More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1423 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  39.47 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  34.75 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  37.68 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  35.84 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  33.03 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  34.91 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  32.11 
 
 		 540 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  28.2 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  28.82 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  33.43 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.59 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  28.73 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  28.73 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  29.75 
 
 		 434 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.73 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.85 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.33 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.85 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.74 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.08 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.41 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.41 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  25.08 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.08 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.41 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.73 
 
 		 343 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.91 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25.67 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.44 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  26.11 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  26.11 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  27.64 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.39 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.3 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  25.17 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  28.09 
 
 		 375 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  24.58 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  26.58 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  24.71 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.85 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.61 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.33 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  28.1 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.32 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.85 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  25.48 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  25.23 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.46 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  24.14 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.45 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.39 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  24.63 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  23.37 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  23.49 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  25.7 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  25.82 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  26.55 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.16 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.16 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  25.48 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  24.23 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  24.23 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.21 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  31.48 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  23.28 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  24.85 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25.26 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  24.23 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  23.39 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  23.05 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.75 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  23.8 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  22.26 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  31.49 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  23.37 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  30.16 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>