More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3257 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1087    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  37.15 
 
 		 391 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  38.94 
 
 		 366 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  36.98 
 
 		 377 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  32.6 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  35.57 
 
 		 378 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  30.08 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  35.03 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  34.3 
 
 		 372 aa  176  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  32.11 
 
 		 368 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  27.49 
 
 		 368 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  27.23 
 
 		 372 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  28.93 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.84 
 
 		 366 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.3 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.72 
 
 		 369 aa  107  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  27.86 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  25.74 
 
 		 434 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  32.3 
 
 		 370 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.84 
 
 		 341 aa  94  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.89 
 
 		 387 aa  94  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 349 aa  93.6  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 		 373 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  24.01 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  27.69 
 
 		 345 aa  91.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.41 
 
 		 361 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.41 
 
 		 361 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.41 
 
 		 361 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  21.55 
 
 		 348 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  21.55 
 
 		 361 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.55 
 
 		 348 aa  90.5  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  21.13 
 
 		 373 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.07 
 
 		 398 aa  90.1  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 529 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  21.26 
 
 		 361 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  21.26 
 
 		 361 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 388 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.07 
 
 		 423 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  31.19 
 
 		 354 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  20.74 
 
 		 361 aa  87.4  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 417 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.39 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30.53 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.39 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25.96 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  27.4 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  20.69 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.17 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.57 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.33 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.72 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  33.1 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  22.51 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  26.22 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  33.97 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  30.25 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  28.14 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.6 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25 
 
 		 351 aa  80.1  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  27.51 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  30.35 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.01 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  27.25 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  25.65 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  31.79 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.46 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  24.03 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  25.2 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  23.99 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  25.25 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  33.91 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  31.21 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  33.91 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  29.44 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  32.87 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  28.48 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  26.22 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  26.32 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  29.94 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  26.27 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  27.32 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  28.25 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  25.8 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.93 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  28.48 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  27.05 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.16 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  29.91 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  22.78 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.67 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.65 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  25.3 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>