More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1755 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  740    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  35.2 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  32.69 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  33.97 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  33.24 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  34.3 
 
 		 540 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  31.83 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  31.83 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  33.23 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  28.37 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.53 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  28.79 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.06 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.05 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.28 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.76 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.76 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.76 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.3 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.76 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.41 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.76 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.76 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.76 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.3 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.76 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.52 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.29 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.12 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.32 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.29 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.16 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.78 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.27 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  23.17 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  24.56 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  24.85 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.78 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  23.55 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  22.95 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.85 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.85 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.85 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.85 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.85 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  22.81 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  29.23 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.56 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  23.55 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  23.4 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  28.71 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  25.52 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.56 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.2 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.18 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  23.66 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  24.91 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  22.88 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.03 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  27.14 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  27.08 
 
 		 436 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.57 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.8 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  27.17 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  28.68 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  23.78 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  22.26 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  28.77 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.19 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  24.64 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  24.89 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  31.69 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.13 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  22.97 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  22.34 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  23.37 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  33.58 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  33.58 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>