More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1102 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  751    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1050  permease  52.14 
 
 
378 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  35.48 
 
 
400 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  33.97 
 
 
372 aa  192  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  35.21 
 
 
368 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  34.12 
 
 
391 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  31.75 
 
 
366 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  34.77 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  35.06 
 
 
540 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 
407 aa  156  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  28.45 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  28.77 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  28.24 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  31.79 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  26.91 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  26.42 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.71 
 
 
369 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 
349 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.24 
 
 
351 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  26.8 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 
354 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.52 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.85 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  25.3 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  28.27 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  23.88 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  27.12 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  23.97 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  24.52 
 
 
353 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  22.99 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  25.85 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.99 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.99 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  22.99 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.99 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  30.94 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.79 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  22.8 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  28.23 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.11 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.8 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.31 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.36 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  35.86 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  29.92 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  26.06 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  34.85 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 
529 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  28.09 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.11 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.55 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  26.83 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  37.59 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  25.15 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  25.48 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  26.43 
 
 
361 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  23.29 
 
 
375 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  28.25 
 
 
370 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.83 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  24.45 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  24.47 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  28.69 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  25.15 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  26.42 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.86 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  26.72 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.63 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.1 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.1 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.1 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.1 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.6 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.62 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  36.84 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  25.93 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  23.1 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.21 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.7 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  23.59 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  27.19 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  24.9 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.47 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  26.3 
 
 
334 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  28.44 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  24.84 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  27.15 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  26.24 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  26.24 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  26.24 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  27.15 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>