More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1480 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  646    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  646    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0882  hypothetical protein  36.23 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1214  hypothetical protein  32.64 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.91 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  23.86 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.94 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  21.74 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  21.28 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  21.9 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  23.46 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  21.51 
 
 		 357 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  21.85 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2801  hypothetical protein  28.48 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  23.57 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  23.88 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  23.3 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.12 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  24.44 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  23.63 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  23.02 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  20.35 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.35 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  24.32 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  24.28 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.01 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  21.65 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  24.06 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  21.91 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  24.03 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  21.22 
 
 		 412 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  21.26 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  22.06 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  22.36 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  23.25 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  20.35 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  19.87 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  22.93 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  20.94 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  31.76 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  22.71 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  20.94 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  23.12 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  20.94 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  30.2 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  20.76 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  20.94 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.91 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  29.19 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.13 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  20.62 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  21.41 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  21.78 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  20.65 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.33 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  21.81 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.67 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  22.29 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  22.01 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  23.68 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.24 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.24 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1561  putative transport protein  21.21 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22.19 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1709  putative transport protein  21.21 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0814358  hitchhiker  0.000224346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1669  putative transport protein  21.21 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  22.71 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  20.98 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  26.81 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.9 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22.19 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  22.62 
 
 		 434 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  24.68 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  32.03 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  23.81 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  19.46 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3673  hypothetical protein  21.61 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  20.2 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4794  inner membrane protein YhhT  21.61 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03276  hypothetical protein  21.61 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>