More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1632 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  623  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  99.69 
 
 
321 aa  622  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  48.42 
 
 
318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  45.21 
 
 
331 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  36.91 
 
 
324 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  28.27 
 
 
369 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25.82 
 
 
369 aa  86.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  38.62 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  35.04 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  35.04 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  35.04 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  31.31 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  35.04 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  39.04 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  34.31 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  34.31 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  34.31 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  34.31 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  34.31 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  29.53 
 
 
361 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  32.85 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  23.49 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.97 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.65 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.19 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.19 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.19 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.67 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.19 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.19 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.36 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.36 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  23.8 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  25.08 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  23.8 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  24.9 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  24.9 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  22.4 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  24.71 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  24.47 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  22.48 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  25.81 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.42 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  25.27 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  23.58 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  24.05 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  24.05 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  24.05 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  24.05 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  24.05 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  27.47 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  24.05 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.69 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  26.18 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.45 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  23.05 
 
 
383 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  22.05 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  25.26 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.83 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  22.46 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 
349 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  22.46 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  23.51 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  22.17 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.11 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.69 
 
 
358 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.52 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.51 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  24.2 
 
 
412 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001931  putative permease protein  23.53 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.52 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  24.67 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  24.34 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  29.63 
 
 
412 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  27.69 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  28.08 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  23.68 
 
 
352 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  27.84 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  22.32 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.75 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  27.84 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  30.71 
 
 
426 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  27.22 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  25.09 
 
 
381 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2477  hypothetical protein  27.39 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  21.51 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  24.9 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  24.82 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.97 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.4 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  25.09 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  28.5 
 
 
644 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  24.82 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>