More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2589 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  96.55 
 
 		 348 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  33.23 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.23 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.23 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.58 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.45 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  27.63 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.11 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  23.15 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  30.51 
 
 		 394 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  27.89 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  26.76 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  26.21 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 		 354 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  29.57 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  25.73 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  23.58 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  24.05 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.02 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.02 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.79 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.34 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.34 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.34 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.34 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.34 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.53 
 
 		 356 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  21.45 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  25.44 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.06 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  24.12 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  22.04 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  21.45 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.33 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  21.05 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.58 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.11 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  24.74 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  27.8 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.1 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  29.79 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  24.92 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  25.97 
 
 		 665 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  27.15 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  25.77 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  25.77 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  20.13 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.64 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.38 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  23.4 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.66 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  24.57 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  29.06 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  25.99 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  25.68 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.81 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  23.96 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  23.23 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  25.14 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  25.68 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  22.45 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  19.69 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  29.44 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.03 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  22.67 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  29.57 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  24.37 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.93 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25.52 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.34 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  23.32 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26.73 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  27.56 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  31.25 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.24 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.52 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.91 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  23.98 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  26.6 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  22.68 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.39 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  24.47 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  23.28 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.17 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.15 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.15 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.71 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.71 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>