More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0888 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  726    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  36.04 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  35 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  37.35 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  38.02 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  38.02 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  38.02 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  36.11 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  36.11 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  35.79 
 
 		 372 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  37.65 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  37.43 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  37.43 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  34.72 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  37.65 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  32.96 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  34.36 
 
 		 372 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  37.05 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  35.83 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  31.32 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  35.42 
 
 		 365 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  33.02 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  30.09 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  31.37 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  29.33 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  29.94 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  28.21 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  29.34 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  27.83 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  31.09 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  27.59 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  28.39 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  24.18 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  26.12 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.33 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  28.72 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.49 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  22.47 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.43 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  25.81 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  28.16 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.81 
 
 		 345 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  26.6 
 
 		 403 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  28.17 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  23.81 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  25.16 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.04 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  28.16 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  29.56 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  28.35 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.71 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  27.04 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  25.69 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  27.88 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  22.19 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  26.73 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.24 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  29.48 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.59 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.21 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  23.43 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  20.39 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  21.67 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.48 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  24.52 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  21.2 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.84 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  21.68 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.8 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  24.21 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  24.04 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  22.13 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  20.77 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  26.44 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  24.1 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  23.1 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  24.32 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  24.68 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  26.25 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  25.07 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  24.52 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  24.19 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.56 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  24.04 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  23.51 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  23.1 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  25.86 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  22.77 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  23.72 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.15 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3493  protein of unknown function UPF0118  25.65 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.39 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>