More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2466 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 
343 aa  658    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  73.31 
 
 
341 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  37.21 
 
 
354 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  33.43 
 
 
372 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  34.76 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  34.76 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  34.76 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  34.55 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  34.76 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  34.76 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  34.76 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  34.45 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  34.45 
 
 
372 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  32.4 
 
 
362 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  34.92 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  30.41 
 
 
366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  33.9 
 
 
372 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  29.85 
 
 
362 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  31.15 
 
 
358 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  33.23 
 
 
372 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  28.44 
 
 
355 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  26.69 
 
 
353 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  27.95 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  29.15 
 
 
383 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  30.25 
 
 
356 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  27.3 
 
 
360 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  29.97 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  31.09 
 
 
365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  25.83 
 
 
375 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  26.65 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  24.86 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  30.84 
 
 
351 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  25.32 
 
 
374 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  26.4 
 
 
371 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  26.37 
 
 
354 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  27.27 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  21.67 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.78 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  21.89 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  22.67 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  27.35 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.15 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  22.26 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  23.05 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  22.59 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  23.23 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.96 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.38 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.37 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  25.87 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  21.47 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  22.13 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.38 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  20.07 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.45 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.29 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  25.95 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.67 
 
 
423 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 
389 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  20.92 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  25.31 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.72 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25.1 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  26.8 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.55 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.34 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.34 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.34 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  23.05 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.34 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.34 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  22.8 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  22.8 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  21.02 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.75 
 
 
405 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  21.65 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  23.17 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  20.65 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  22.55 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  20.87 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.61 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  24.41 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  24.61 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  22.88 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  20.95 
 
 
394 aa  57.4  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  21.17 
 
 
396 aa  55.8  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  22.96 
 
 
365 aa  55.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  25.71 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  21.94 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.94 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  23.2 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  22.88 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  21.17 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  24.89 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  20.86 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>