203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2662 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  98.59 
 
 		 354 aa  649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 		 354 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  27.13 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  27.78 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  27.78 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  27.78 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  27.78 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  27.78 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  27.78 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  28.49 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  28.78 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  30.08 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  27.78 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  31 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  28.78 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  30.14 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  25.71 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  26.55 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  27.55 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  25.24 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  26.91 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  25.53 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  25.56 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  27.36 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  27.88 
 
 		 362 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  28.16 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  27.89 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  23.62 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  31.72 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  26.36 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  27.67 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  23.51 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  26.44 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  25.68 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  20.57 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  27.68 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.83 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.59 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.27 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.64 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  21.77 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  26.85 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  25.53 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.46 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.29 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.66 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.66 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.7 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.7 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.1 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  24.85 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.1 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.1 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.24 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.6 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  20.17 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  25.93 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.7 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.7 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.7 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  21.57 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.5 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.9 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  31.33 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  29.75 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  22 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.58 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  19.61 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.39 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  29.38 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  34.33 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  20.89 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.85 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.27 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  20.93 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  28.68 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  25.12 
 
 		 434 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1751  permease  28.03 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.976509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  27.16 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  23.39 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  22.94 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  23.88 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 417 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>