More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3488 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 		 374 aa  730    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  31.25 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  31.83 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  30.88 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  30.88 
 
 		 372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  29.71 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  29.71 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  29.71 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  29.43 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  29.71 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  29.71 
 
 		 372 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  29.71 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  29.71 
 
 		 372 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  32.05 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  28.53 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  29.2 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  29.46 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  31.82 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  29.94 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  29.56 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  29.86 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  26.14 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  27.41 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  29.37 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  23.64 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  25.91 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  26.85 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  26.14 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.16 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  24.61 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.99 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  28.97 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.52 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.7 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.52 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  28.44 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  25.32 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  25.63 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.51 
 
 		 354 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  24.24 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.61 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  20.78 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  25.97 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  21.71 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  22.76 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  24.41 
 
 		 665 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  26.39 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  24.31 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  20.76 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  20.31 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.02 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.25 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.14 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  23.96 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  23.96 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  22.93 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  22.08 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  29.38 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  23.26 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.45 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  22.91 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  25.3 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  24.76 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  27.51 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  21.34 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  24.34 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.2 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.89 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.53 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  24.48 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  22.6 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.53 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  22.88 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  21.73 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.46 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  24.78 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  23.6 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  21.36 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  23.42 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  25.49 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.57 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.17 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  20.99 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  21.57 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.17 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.17 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  22.55 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  19.74 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.17 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.17 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  23.44 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>