More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1013 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  705    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  42.07 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  38.19 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  33.33 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  37.28 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  33.99 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  32.8 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  33.15 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  33.15 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  32.87 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  33.15 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  33.15 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  33.15 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  33.15 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  33.15 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  32.23 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  32.29 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  32.59 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  31.56 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  30.94 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  29.03 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  31.53 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  29.69 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  30.34 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  31.1 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  27.61 
 
 		 355 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  29.17 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  29.27 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  29.11 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  31.85 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  25.72 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  25.97 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  27.24 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  27.18 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  27.36 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  24.85 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2984  sporulation integral membrane protein YtvI  27.51 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1589  protein of unknown function UPF0118  26.1 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.62 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  22.48 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.61 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.59 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  24.68 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  23.71 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.97 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  24.86 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.08 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  27.51 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  24 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  23.33 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  20.59 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  22.82 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  20.59 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  25.79 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  27.3 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  23.43 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  21.59 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  21.73 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  23.12 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  24.92 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.04 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  23.61 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  25.55 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  28.3 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  22.91 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  23.82 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  23.67 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.5 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  28.7 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  25.55 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.72 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  24.46 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.4 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  23.87 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  23.81 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.46 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  23.96 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  23.18 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  22.83 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.67 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  21.45 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  22.95 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  21.11 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  22.88 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  22.88 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.78 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  21.11 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  21.52 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  20.92 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  21.67 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>